Beaucoup de champignons ne peuvent pas être identifiés de façon fiable à l'œil nu. Deux espèces brunes peuvent sembler presque identiques sur le terrain tout en différant nettement par la taille, la forme et l'ornementation de leurs spores ou par les cellules de leurs lames. C'est pourquoi le microscope est l'outil le plus important des mycologues amateurs avertis comme des professionnels. Ce guide explique quel matériel il vous faut, comment faire une sporée, quels liquides de montage et réactifs utiliser, quoi observer et comment manipuler les produits chimiques en toute sécurité.
Pourquoi utiliser un microscope pour les champignons ?
Les caractères microscopiques sont souvent décisifs dans les clés d'identification des champignons. La taille et la forme des spores, la structure du revêtement du chapeau, la présence de boucles ou de cystides particulières permettent de séparer des genres et des espèces qui se ressemblent. La microscopie éduque aussi le regard : une fois que vous avez vu les spores verruqueuses d'une Russula ou les longs asques fins d'une pézize, vous comprenez l'organisme autrement.
Un point doit être clair dès le départ. La microscopie est un outil d'identification et d'étude, pas un raccourci pour décider de ce qui est comestible. Ne consommez jamais un champignon sauvage s'il n'a pas été identifié par un expert qualifié. Si vous découvrez les champignons de manière générale, notre cours Fondamentaux de la mycologie vous apporte les bases qui donnent tout leur sens aux caractères microscopiques.
Le matériel nécessaire
Nul besoin d'un laboratoire de recherche, mais il vous faut un véritable microscope optique composé. Les microscopes jouets et les modèles bon marché à optique en plastique sont une fausse économie frustrante.
| Élément | Ce qu'il faut rechercher |
|---|---|
| Microscope optique composé | Tête binoculaire ou trinoculaire, objectifs d'environ 4x, 10x, 40x et un objectif à immersion 100x, condenseur d'Abbe à diaphragme réglable et platine mécanique. Un bon microscope de laboratoire d'occasion offre souvent un meilleur rapport qualité-prix qu'un modèle neuf d'entrée de gamme. |
| Outils de mesure | Un oculaire micrométrique et un micromètre objectif pour l'étalonner, ou une caméra avec logiciel de mesure étalonné de la même manière. |
| Loupe binoculaire ou loupe à main | Utile pour les arêtes des lames, les poils de surface et les petits champignons à faible grossissement. |
| Consommables | Lames, lamelles, huile d'immersion, papier optique, flacons compte-gouttes. |
| Outils | Lames de rasoir neuves, pinces fines, aiguilles lancéolées, petit pinceau. |
Les spores de nombreux champignons ne mesurent que quelques micromètres : l'objectif à immersion, pour un grossissement total d'environ 1000x, est donc celui que vous utiliserez pour les mesures et l'ornementation. Apprenez à régler correctement le microscope, y compris l'éclairage de Köhler lorsque votre modèle le permet ; un bon éclairage améliore davantage l'image que n'importe quel équipement supplémentaire. L'ensemble de la démarche, du réglage du microscope au dessin et à la mesure, est enseigné dans Microscopie pour mycologues.
Faire une sporée
Une sporée montre la couleur des spores en masse, un caractère d'identification de base, et vous fournit une réserve de spores mûres à mesurer.
- Coupez le pied d'un chapeau frais et mûr au ras des lames ou des pores.
- Posez le chapeau, face fertile vers le bas, sur un morceau de verre, de papier aluminium ou de papier. Une feuille mi-blanche, mi-noire permet de voir aussi bien les sporées claires que foncées.
- Couvrez-le d'un bol ou d'un verre pour éviter les courants d'air et le dessèchement.
- Laissez reposer plusieurs heures ou toute une nuit à température ambiante.
- Soulevez délicatement le chapeau, notez la couleur à la lumière du jour et étiquetez la sporée avec la date, le lieu et le numéro de récolte.
Les spores issues d'une sporée sont mûres et donnent des mesures plus fiables que celles prélevées sur de jeunes lames. Conservez les sporées sèches dans des enveloppes étiquetées : elles se gardent longtemps. Tenir de bons registres est la première étape pour constituer une collection de référence, sujet traité dans Collections fongiques et gestion d'un fongarium.
Liquides de montage et réactifs
Pour la plupart des observations, on place un minuscule fragment de tissu ou quelques spores dans une goutte de liquide, on ajoute une lamelle et on presse doucement. Le liquide choisi change ce que l'on voit.
- Eau. Le milieu de référence pour le matériel frais. Elle montre les couleurs naturelles et sert de référence à de nombreuses mesures de spores publiées.
- Hydroxyde de potassium (KOH) dilué. Il ravive le matériel séché et facilite la dissociation des tissus. Certaines structures changent de couleur dans le KOH, ce qui constitue un caractère à part entière. Il est corrosif.
- Ammoniaque diluée. Utilisée de façon semblable au KOH et comme solvant du rouge Congo.
- Rouge Congo. Colore les parois cellulaires en rouge et rend les hyphes, les basides et les cystides bien plus visibles.
- Réactif de Melzer. Une solution iodée qui indique si les spores ou les tissus sont amyloïdes (gris-bleu à noir), dextrinoïdes (brun-rouge) ou non amyloïdes (aucune réaction). Il est indispensable pour de nombreux genres. Il contient de l'hydrate de chloral, un sédatif médicamenteux toxique dont la vente est restreinte dans plusieurs pays.
- Lugol. Une solution iodée plus simple, sans hydrate de chloral, que beaucoup de spécialistes préfèrent pour les ascomycètes. Ses réactions ne sont pas identiques à celles du Melzer : notez donc toujours le réactif utilisé.
- Bleu coton et phloxine. Colorants servant à mettre en évidence l'ornementation des spores ou le contenu cellulaire. Les formulations traditionnelles au lactophénol contiennent du phénol, qui est toxique ; il existe des alternatives sans phénol.
Ce qu'il faut observer
Les spores
Mesurez au moins 20 à 30 spores mûres issues d'une sporée, notez la longueur et la largeur, et calculez l'étendue, la moyenne et le rapport longueur sur largeur, appelé Q. Notez la forme (ronde, elliptique, amygdaliforme, anguleuse), l'épaisseur de la paroi, toute ornementation comme des verrues, des épines ou des crêtes, la présence d'un pore germinatif et la réaction au réactif de Melzer.
Hyménium et revêtement du chapeau
- Basides. Les cellules qui produisent les spores chez les champignons à lames et à tubes ; notez leur forme et le nombre de stérigmates, en général quatre, parfois deux.
- Cystides. Cellules stériles situées sur l'arête des lames (cheilocystides), sur leurs faces (pleurocystides) ou sur le chapeau et le pied. Leur forme est souvent déterminante.
- Piléipellis. La structure du revêtement du chapeau, par exemple des hyphes couchées ou des cellules dressées et arrondies, est un caractère clé dans de nombreux genres.
- Boucles. Petits ponts au niveau des cloisons des hyphes, présents dans de nombreux groupes et absents dans d'autres.
Ascomycètes
Chez les pézizes et les morilles, on observe les asques, les paraphyses situées entre eux et la réaction iodée du sommet de l'asque. Des dessins ou des photographies précis de tous ces éléments valent l'effort ; Photographie et illustration scientifiques des champignons montre comment documenter vos observations au niveau d'une publication.
Travailler en sécurité avec les réactifs
- Lisez la fiche de données de sécurité. Chaque fournisseur doit en fournir une pour les produits chimiques dangereux. Suivez les consignes de stockage et d'équipement de protection.
- Protégez vos yeux et votre peau. Le KOH et l'ammoniaque sont corrosifs ; portez des lunettes de sécurité et des gants pour préparer ou transvaser les solutions.
- Aérez. Travaillez l'ammoniaque et les solvants de colorants dans une pièce bien ventilée.
- Étiquetez et rangez sous clé. Conservez les réactifs dans des flacons compte-gouttes clairement étiquetés, hors de portée des enfants et des animaux, et jamais dans des contenants alimentaires.
- Pas de nourriture au poste de travail. Ne mangez, ne buvez et ne goûtez rien pendant le travail, et lavez-vous les mains ensuite.
- Éliminez correctement. Ne versez pas les restes de réactifs dans l'évier ; apportez-les à la collecte de déchets dangereux prévue par votre collectivité.
- Spores et allergies. De grandes quantités de spores peuvent irriter les voies respiratoires. Gardez les sporées couvertes et n'inhalez pas la poussière de spores.
La microscopie des champignons en Suisse
En Suisse, de nombreux passionnés associent cueillette et microscopie, et plusieurs organisations les accompagnent.
- Sociétés mycologiques. L'Union suisse des sociétés mycologiques (USSM) et ses nombreuses sociétés locales proposent des soirées de détermination, des excursions et des cours de microscopie. Le contrôle des champignons destinés à la consommation relève des postes officiels de contrôle des communes, dont les contrôleuses et contrôleurs sont en général formés par la VAPKO. Ne consommez jamais un champignon sans identification par un spécialiste.
- Données d'observation. SwissFungi, le centre national de données et d'informations sur les champignons, rattaché à l'Institut fédéral de recherches WSL, recueille les observations. Les récoltes bien documentées, avec leurs caractères microscopiques, y sont particulièrement précieuses.
- Achat des réactifs. La remise de produits chimiques dangereux est régie par l'ordonnance sur les produits chimiques (OChim). Certaines substances font l'objet de restrictions de remise aux utilisateurs privés, et le personnel de vente doit disposer des connaissances techniques requises. Les services cantonaux des produits chimiques vous renseignent. Les réactifs prêts à l'emploi sont disponibles chez des fournisseurs spécialisés en matériel de laboratoire.
- Élimination et règles de cueillette. Les restes de réactifs doivent être apportés à la collecte des déchets spéciaux ; votre commune vous indique les points de collecte. La cueillette des champignons, y compris d'échantillons d'étude, est réglée par les cantons et parfois par les communes, par exemple avec des limites de quantité ou des jours sans cueillette. Les dispositions varient d'un canton à l'autre.
Apprendre la microscopie avec des experts
La microscopie s'apprend plus vite avec les retours de mycologues expérimentés. L'École de mycologie et de sciences fongiques propose des cours en ligne en direct qui associent théorie et observation guidée, et l'École de mycologie culinaire et de cueillette relie les compétences d'identification à une cueillette sûre. Pour combiner terrain et microscope, suivez Identification des macromycètes sur le terrain et Taxonomie et systématique des champignons, ou allez plus loin avec le Certificat en mycologie de terrain et identification des champignons de Fungaris.