Barcoding ADN pour cueilleurs
Découvrez comment le séquençage de l'ADN transforme l'identification des champignons et comment les mycologues amateurs peuvent participer à des projets de séquençage.
Un aperçu de ce que vous allez étudier et réaliser.
Ce cours explique comment le séquençage de l'ADN transforme l'identification des champignons et comment les amateurs peuvent y participer. Les participants commencent par examiner les limites de la morphologie et les espèces cryptiques, identiques en apparence mais génétiquement distinctes. Ils découvrent ce que sont les codes-barres ADN fongiques, en particulier la région ITS, puis s'exercent à prélever et envoyer correctement des spécimens. D'autres modules enseignent à lire les résultats de séquençage et les correspondances dans les bases de données, présentent le séquençage portable et participatif, et expliquent comment les évolutions taxonomiques conduisent à de nouveaux noms pour des espèces familières.
Le séquençage à coût abordable a ouvert l'identification moléculaire aux sociétés mycologiques et aux amateurs passionnés, dont les données redessinent déjà les listes d'espèces. Ce programme s'adresse aux cueilleurs avancés et aux mycologues amateurs à l'aise avec les contenus techniques. Il est enseigné en direct par des mycologues qui pilotent des projets de séquençage participatif. Pour le projet final, chaque participant prépare un lot de spécimens documentés prêts pour le séquençage et interprète des exemples de résultats, en rédigeant un court rapport sur ce que les données confirment et ne confirment pas.
6 modules, un savoir qui grandit pas à pas.
Survolez ou touchez un module pour suivre le parcours, de la première séance au projet final. Ouvrez un module pour voir les thèmes abordés.
- Espèces cryptiques et sosies
- Limites des caractères macroscopiques
- Quand les données moléculaires sont nécessaires
- Ce qu'est un code-barres ADN
- La région ITS et les autres marqueurs
- Bases de données de référence
- Prélever des échantillons de tissu propres
- Étiquetage et spécimens de référence
- Envoi aux services de séquençage
- Lire les fichiers de séquences et leur qualité
- Recherches en base de données et pourcentages de correspondance
- Interpréter les résultats ambigus
- Séquenceurs portables
- Initiatives de séquençage participatif
- Coûts et installations pratiques
- Comment les noms des champignons changent
- Suivre les mises à jour taxonomiques
- Expliquer les changements de noms aux autres
Barcoding ADN pour cueilleurs
À l’issue de la formation, vous saurez :
- Expliquer pourquoi certains champignons ne peuvent pas être identifiés par la seule morphologie.
- Décrire le fonctionnement des codes-barres ADN et des bases de données de référence.
- Récolter et envoyer des spécimens adaptés au séquençage.
- Interpréter avec un esprit critique des résultats de séquençage simples et des correspondances en base de données.
- Suivre et expliquer les changements taxonomiques des noms de champignons.
La place de cette formation dans l’école.
Où cette formation peut vous mener.
Des métiers et des applications qui s’appuient sur ce que vous apprenez ici. Les débouchés dépendent de votre expérience et du marché local.
- Coordinateur séquençage d'une société mycologique
- Amateur avancé contribuant à la recherche fongique
- Bénévole ou assistant d'herbier
- Assistant d'inventaire de terrain pour des projets écologiques
- Médiateur scientifique en taxonomie fongique
Prérequis, évaluation et certificat.
Conditions d’admission
De solides compétences en identification et une aisance avec les notions techniques sont recommandées. Aucune expérience de laboratoire n'est nécessaire.
Modalités d’évaluation
La progression est évaluée à travers la participation aux sessions en direct, des exercices d'interprétation dans chaque module et un projet final évalué par le professeur.
Projet final
Un lot de spécimens documentés prêts pour le séquençage, accompagné d'un court rapport interprétant des exemples de résultats de séquençage.
Certificat
Certificat de cours
À l’issue de la formation et de son projet, Fungaris délivre un Certificat de cours. La reconnaissance des formations est évaluée en fonction du parcours suivi et de la réglementation locale de chaque pays.
Comment la formation progresse, phase par phase.
- Pourquoi la morphologie ne suffit pas toujours
- Les codes-barres ADN fongiques expliqués
- Prélever et envoyer des spécimens
- Lire les résultats de séquençage
- Séquençage portable et participatif
- Évolution taxonomique et changements de noms
Recherches associées
Questions sur cette formation
Faut-il de l’expérience pour suivre la formation « Barcoding ADN pour cueilleurs » ?
De solides compétences en identification et une aisance avec les notions techniques sont recommandées. Aucune expérience de laboratoire n'est nécessaire.
Comment se déroule la formation « Barcoding ADN pour cueilleurs » ?
En direct en ligne, en 6 modules, avec un professionnel en activité, un petit groupe et un projet final.
Comment suis-je évalué ?
La progression est évaluée à travers la participation aux sessions en direct, des exercices d'interprétation dans chaque module et un projet final évalué par le professeur.
En quoi consiste le projet final ?
Un lot de spécimens documentés prêts pour le séquençage, accompagné d'un court rapport interprétant des exemples de résultats de séquençage.
Quel certificat vais-je obtenir ?
À l’issue de la formation et de son projet, Fungaris délivre un Certificat de cours. La reconnaissance des formations est évaluée en fonction du parcours suivi et de la réglementation locale de chaque pays.
Que puis-je étudier après la formation « Barcoding ADN pour cueilleurs » ?
L’étape suivante naturelle est la formation « Certificat en mycologie culinaire ».
À lire avant de commencer.
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