Certificat de mycologie moléculaire
Les outils moléculaires pour étudier les champignons, du code-barres ADN et du diagnostic par PCR à la génomique, au métabarcoding et à l'édition génomique.
Un aperçu de ce que vous allez étudier et réaliser.
Le Certificat de mycologie moléculaire fournit une boîte à outils complète pour étudier les champignons à l'échelle de l'ADN et de l'ARN. Après une remise à niveau sur les bases de la biologie moléculaire, vous maîtriserez l'extraction d'ADN et la PCR à partir de matériels fongiques variés, l'identification par séquences avec les codes-barres ADN et la PCR quantitative pour la détection et le diagnostic. Les modules suivants couvrent l'analyse phylogénétique, le séquençage et l'annotation de génomes, le métabarcoding des communautés fongiques, ainsi que l'étude de l'expression génique et l'édition du génome avec des outils fondés sur CRISPR.
Les méthodes moléculaires fondent aujourd'hui la taxonomie, le diagnostic, l'écologie et les biotechnologies fongiques, et les employeurs attendent des scientifiques capables à la fois de mener le travail de paillasse et d'interpréter les données. Ce certificat s'adresse aux scientifiques de laboratoire et aux doctorants qui recherchent une formation structurée de niveau professionnel plutôt que des protocoles épars. Chaque module associe explications en direct et exercices sur des jeux de données réels avec des outils libres. Dans le projet final, vous concevrez et réaliserez, ou analyserez, une étude moléculaire portant sur une question fongique de votre domaine, en présentant méthodes, résultats et interprétation sous la forme d'un court rapport scientifique.
8 modules, un savoir qui grandit pas à pas.
Survolez ou touchez un module pour suivre le parcours, de la première séance au projet final. Ouvrez un module pour voir les thèmes abordés.
- ADN, ARN et structure des gènes
- Enzymes et outils moléculaires
- Qualité au laboratoire et contaminations
- Extraction à partir de tissus et de cultures
- Échantillons difficiles et dégradés
- Optimisation et dépannage de la PCR
- Marqueurs code-barres pour les champignons
- Édition des séquences et bases de données
- Interpréter les résultats d'identification
- Chimie et conception de la qPCR
- Validation des tests
- Applications diagnostiques
- Alignement et sélection de modèles
- Méthodes d'inférence d'arbres
- Interpréter les phylogénies
- Séquençage et assemblage
- Prédiction de gènes
- Annotation fonctionnelle
- Échantillonnage et préparation des banques
- Traitement bioinformatique
- Analyse des communautés
- Extraction d'ARN et RT-qPCR
- Bases de la transcriptomique
- Édition du génome par CRISPR chez les champignons
Certificat de mycologie moléculaire
À l’issue de la formation, vous saurez :
- Extraire des acides nucléiques et optimiser la PCR pour des échantillons fongiques variés.
- Identifier des champignons à partir de séquences en interprétant les bases de données avec esprit critique.
- Concevoir et valider des tests qPCR de détection des champignons.
- Construire des phylogénies et annoter des génomes fongiques avec des outils libres.
- Planifier des expériences de métabarcoding, d'expression génique et d'édition du génome.
La place de cette formation dans l’école.
Où cette formation peut vous mener.
Des métiers et des applications qui s’appuient sur ce que vous apprenez ici. Les débouchés dépendent de votre expérience et du marché local.
- Biologiste moléculaire dans un laboratoire de mycologie
- Scientifique de laboratoire de diagnostic utilisant des méthodes PCR
- Technicien de recherche en génomique fongique
- Scientifique en biotechnologies travaillant sur des souches fongiques
- Écologue moléculaire
- Responsable de laboratoire dans un service de séquençage
Prérequis, évaluation et certificat.
Conditions d’admission
Une formation en biologie et une expérience de base en laboratoire sont attendues. Un ordinateur capable de faire tourner des logiciels d'analyse gratuits est nécessaire pour les exercices sur données.
Modalités d’évaluation
L'évaluation associe la participation aux séances en direct, des exercices pratiques et sur données dans chaque module, et un projet final relu par le professeur.
Projet final
Une étude moléculaire portant sur une question fongique de votre domaine, présentée avec méthodes, résultats et interprétation.
Certificat
Certificat de spécialisation
À l’issue de la formation et de son projet, Fungaris délivre un Certificat de spécialisation. La reconnaissance des formations est évaluée en fonction du parcours suivi et de la réglementation locale de chaque pays.
Comment la formation progresse, phase par phase.
- Bases de biologie moléculaire pour mycologues
- Extraction d'ADN et PCR chez les champignons
- Code-barres ADN et identification par séquences
- PCR quantitative et diagnostic moléculaire
- Analyse phylogénétique
- Génomique et annotation fongiques
- Métabarcoding des communautés fongiques
- Expression génique et édition du génome chez les champignons
Recherches associées
Questions sur cette formation
Faut-il de l’expérience pour suivre la formation « Certificat de mycologie moléculaire » ?
Une formation en biologie et une expérience de base en laboratoire sont attendues. Un ordinateur capable de faire tourner des logiciels d'analyse gratuits est nécessaire pour les exercices sur données.
Comment se déroule la formation « Certificat de mycologie moléculaire » ?
En direct en ligne, en 8 modules, avec un professionnel en activité, un petit groupe et un projet final.
Comment suis-je évalué ?
L'évaluation associe la participation aux séances en direct, des exercices pratiques et sur données dans chaque module, et un projet final relu par le professeur.
En quoi consiste le projet final ?
Une étude moléculaire portant sur une question fongique de votre domaine, présentée avec méthodes, résultats et interprétation.
Quel certificat vais-je obtenir ?
À l’issue de la formation et de son projet, Fungaris délivre un Certificat de spécialisation. La reconnaissance des formations est évaluée en fonction du parcours suivi et de la réglementation locale de chaque pays.
Que puis-je étudier après la formation « Certificat de mycologie moléculaire » ?
L’étape suivante naturelle est la formation « Programme expert en mycologie ».
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