
Diplomado en Bioinformática Fúngica
Un itinerario práctico completo desde la línea de comandos hasta el ensamblaje, la anotación, la genómica comparada y la transcriptómica de hongos.
Qué vas a estudiar y qué vas a construir.
Este diplomado ofrece un itinerario práctico completo para biólogos que quieren trabajar con soltura con datos genómicos de hongos. A lo largo de ocho módulos pasarás de la línea de comandos de Linux y la computación de alto rendimiento a los formatos de secuencia y el control de calidad, y de ahí al ensamblaje y la anotación de genomas. Después compararás genomas, inferirás ortologías y filogenias y analizarás la expresión génica con transcriptómica, encadenando las competencias en un flujo coherente.
Los datos genómicos ya orientan la taxonomía fúngica, la fitopatología, la biotecnología y la ecología, y crece la demanda de perfiles que unan comprensión biológica y habilidades computacionales. Los cursos breves rara vez dan tiempo a consolidar toda la cadena, desde las lecturas hasta la interpretación biológica. El diplomado se dirige a biólogos que dan el salto al trabajo computacional y tienen alguna experiencia básica con la terminal o la programación. En el proyecto final llevarás a cabo un proyecto genómico completo, desde las lecturas hasta un genoma anotado situado en su contexto comparado y filogenético, con informe escrito.
8 módulos, una línea de conocimiento que crece.
Pasa el ratón o toca un módulo para seguir el camino desde la primera sesión hasta el proyecto final. Abre un módulo para ver los temas que trata.
- Comandos de terminal y manejo de archivos
- Scripts en Bash y bucles
- Trabajo en clústeres HPC
- Formatos FASTA, FASTQ, SAM y VCF
- Evaluación de la calidad de lecturas
- Recorte y filtrado
- Algoritmos de ensamblaje
- Ensamblaje con lecturas largas e híbrido
- Evaluar la calidad del ensamblaje
- Enmascarado de repeticiones
- Predicción génica con evidencias
- Anotación funcional
- Inferencia de ortología
- Evolución de familias génicas
- Sintenia y comparación de genomas
- Alineamiento y selección de modelos
- Árboles génicos y de especies
- Conjuntos de datos filogenómicos
- Diseño y procesamiento de RNA-seq
- Expresión diferencial
- Enriquecimiento funcional
- Diseño del proyecto y elección de datos
- Ejecutar el flujo completo
- Informe y presentación de resultados
Diplomado en Bioinformática Fúngica
Al terminar sabrás:
- Trabajar con eficiencia en Linux y sistemas HPC mediante scripts.
- Ensamblar y anotar genomas fúngicos a partir de datos brutos.
- Realizar inferencia de ortología y análisis genómicos comparados.
- Construir árboles génicos y de especies a partir de datos genómicos.
- Analizar datos de RNA-seq e interpretar resultados de expresión diferencial.
Dónde se sitúa esta formación en la escuela.
A dónde te puede llevar esta formación.
Puestos y usos que se apoyan en lo que aprendes aquí. Cada salida depende de tu experiencia y del mercado local.
- Bioinformático en un laboratorio de genómica fúngica
- Biólogo computacional en biotecnología
- Analista de genomas en un proveedor de secuenciación
- Investigador asociado en fitopatología
- Especialista en una plataforma de bioinformática
- Analista de datos en genómica agrícola
Requisitos, evaluación y certificado.
Requisitos de acceso
Se espera una titulación o base sólida en biología y cierta familiaridad con la terminal o con algún lenguaje de programación.
Cómo se evalúa
El progreso se evalúa mediante la participación en las sesiones en directo, ejercicios prácticos en cada módulo y un proyecto final revisado por el profesor.
Proyecto final
Un proyecto genómico fúngico completo, desde las lecturas hasta un genoma anotado con análisis comparados y filogenéticos.
Certificado
Certificado de Diplomado
Al completar la formación y su proyecto, Fungaris emite un Certificado de Diplomado. Las acreditaciones se valoran según la formación terminada y la normativa local de cada país.
Cómo crece la formación, fase a fase.
- Linux, computación de alto rendimiento y scripting
- Formatos de datos de secuencia y control de calidad
- Ensamblaje de genomas
- Anotación de genomas
- Genómica comparada y ortología
- Filogenética y filogenómica
- Transcriptómica
- Proyecto final de genoma
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Preguntas sobre esta formación
¿Necesito experiencia para estudiar Diplomado en Bioinformática Fúngica?
Se espera una titulación o base sólida en biología y cierta familiaridad con la terminal o con algún lenguaje de programación.
¿Cómo se imparte Diplomado en Bioinformática Fúngica?
En directo online, en 8 módulos, con un profesional en activo, un grupo reducido y un proyecto final.
¿Cómo se evalúa?
El progreso se evalúa mediante la participación en las sesiones en directo, ejercicios prácticos en cada módulo y un proyecto final revisado por el profesor.
¿En qué consiste el proyecto final?
Un proyecto genómico fúngico completo, desde las lecturas hasta un genoma anotado con análisis comparados y filogenéticos.
¿Qué certificado obtengo?
Al completar la formación y su proyecto, Fungaris emite un Certificado de Diplomado. Las acreditaciones se valoran según la formación terminada y la normativa local de cada país.
¿Qué puedo estudiar después de Diplomado en Bioinformática Fúngica?
El siguiente paso natural es Máster en Genómica y Bioinformática Fúngica.
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