Transkriptomik und Multi-Omics von Pilzen
RNA-seq-Analyse und Integration mit Proteom- und Metabolomdaten, um Reaktionen, Entwicklung und Stoffwechsel von Pilzen zu verstehen.
Programmübersicht
- 1.1Name des Programms
- Transkriptomik und Multi-Omics von Pilzen
- 1.2Art des Abschlusses
- Kurs
- 1.3Anbieter / tragende Institution
- Fungaris – International Institute of Mycology, Schule für Digitale Mykologie: KI, Genomik und Daten. Ein eigenes Programm von Fungaris, nicht von einer Hochschule getragen.
- 1.4Studienform
- Online, mit Live-Sitzungen in kleiner Gruppe, Aufzeichnungen und virtuellem Campus.
- 1.5Dauer (Stunden / ECTS-Punkte)
- 3 Monate (12 Wochen) · 72 Stunden insgesamt · 6 Module à 12 Stunden · 12 Live-Sitzungen à 2 Stunden. ECTS-Punkte: entfällt (eigenes Programm von Fungaris, kein staatlich anerkannter Hochschulabschluss).
- 1.6Sprache
- Deutsch
- 1.7Beginn und Ende / Durchführung
- Nächste Durchführung: 11. Januar 2027 bis 2. April 2027. Anmeldeschluss: 4. Januar 2027. Darauf folgende Durchführung: 8. März 2027. So funktionieren die Durchführungen →
Vorstellung
2.1Beschreibung des Programms
Dieser Kurs führt dich durch RNA-seq von der Versuchsplanung bis zur biologischen Interpretation und zeigt, wie sich die Daten mit Proteomik und Metabolomik verbinden lassen. Du planst Experimente mit ausreichender Wiederholung, mappst und quantifizierst Reads, führst Analysen differenzieller Expression durch und testest auf angereicherte Funktionen und Stoffwechselwege. Einführende Module zu Proteomik und Metabolomik bereiten dich darauf vor, mehrere Datenebenen in einer schlüssigen Analyse zusammenzuführen.
Transkriptomik ist der häufigste Weg, um zu untersuchen, wie Pilze auf Wirte, Substrate, Stress und Entwicklungssignale reagieren, und Multi-Omics-Integration wird in hochwertigen Studien zunehmend erwartet. Schwache Versuchspläne und überinterpretierte Genlisten bleiben jedoch häufige Probleme. Der Kurs richtet sich an Molekularbiologen und Bioinformatiker mit etwas Erfahrung in R oder auf der Kommandozeile. Im Abschlussprojekt analysierst du einen öffentlichen RNA-seq-Datensatz eines Pilzes, ergänzt nach Möglichkeit eine weitere Omics-Ebene und verfasst einen prägnanten Ergebnisteil mit Abbildungen und einer kritischen Diskussion.
2.2Warum es relevant ist / welchen Bedarf es deckt
Es deckt einen praktischen Bedarf: angewandtes, aktuelles Wissen im Bereich Digitale Mykologie, nützlich in Feldern wie Akademische Forschung, Industrielle Biotechnologie, Pflanzengesundheitsforschung, Pharma- und Naturstoffforschung.
Die Mykologie entwickelt sich schnell, gute praxisnahe Weiterbildung ist aber noch selten. Dieses Programm bietet dir einen strukturierten Weg, live vermittelt von Fachleuten aus der Praxis, damit du das Gelernte sicher und überlegt anwendest.
Ziele und Kompetenzen
3.1Übergeordnetes Ziel
Dass du das Programm abschliesst und seine Inhalte fachlich fundiert anwenden kannst. Kurz gesagt:
RNA-seq-Analyse und Integration mit Proteom- und Metabolomdaten, um Reaktionen, Entwicklung und Stoffwechsel von Pilzen zu verstehen.
3.2Spezifische Ziele
- Die Grundlagen aufbauen: Versuchsplanung für RNA-seq; Read-Mapping und Quantifizierung.
- Sie in die Praxis umsetzen: Analyse differenzieller Expression; Funktionelle Anreicherung und Stoffwechselwege.
- Alles an einem echten Fall anwenden: Grundlagen von Proteomik und Metabolomik; Multi-Omics-Datensätze integrieren.
- Ein Abschlussprojekt abschliessen, das deine Lehrperson begutachtet.
3.3Kompetenzen, die du erwirbst
- RNA-seq-Experimente mit geeigneten Wiederholungen und Kontrollen planen.
- RNA-seq-Daten von Pilzen mappen, quantifizieren und qualitätsprüfen.
- Analysen differenzieller Expression mit DESeq2 oder edgeR durchführen.
- Funktionelle Anreicherungsanalysen mit pilzrelevanten Annotationen durchführen.
- Transkriptomische, proteomische und metabolomische Daten schlüssig integrieren.
Teilnehmerprofil
4.1Für wen (Eingangsprofil)
Molekularbiologen und Bioinformatiker.
4.2Zugangsvoraussetzungen
Molekularbiologische Grundkenntnisse und etwas Erfahrung mit R oder der Kommandozeile werden erwartet.
4.3Berufliche Perspektiven (Abschlussprofil)
- Bioinformatiker in einem molekularbiologischen Pilzlabor
- Wissenschaftler im Bereich Wirt-Pilz-Interaktionen
- Omics-Datenanalyst in der Biotechnologie
- Analyst in einer Transkriptomik-Core-Facility
- Postdoc in der Pilzphysiologie
Was davon realistisch ist, hängt von deiner Erfahrung und dem lokalen Markt ab.
Lehrplan
5.1Aufbau (Module und Arbeitsaufwand)
| Modul | Titel | Phase | Themen | Stunden |
|---|---|---|---|---|
| 01 | Versuchsplanung für RNA-seq | Grundlagen | 3 | 12 |
| 02 | Read-Mapping und Quantifizierung | Grundlagen | 3 | 12 |
| 03 | Analyse differenzieller Expression | Praxis | 3 | 12 |
| 04 | Funktionelle Anreicherung und Stoffwechselwege | Praxis | 3 | 12 |
| 05 | Grundlagen von Proteomik und Metabolomik | Anwendung & Projekt | 3 | 12 |
| 06 | Multi-Omics-Datensätze integrieren | Anwendung & Projekt | 3 | 12 |
| Total | 72 |
6 Module × 12 Stunden = 72 Stunden: 24 Stunden Live-Sitzungen, der Rest für Selbststudium auf dem Campus, Übungen und das Abschlussprojekt.
5.2Inhalte nach Modul
Fahre über ein Modul oder tippe es an, um den Weg von der ersten Sitzung bis zum Abschlussprojekt zu verfolgen. Öffne ein Modul, um seine Themen zu sehen.
- Welche Fragen RNA-seq beantworten kann
- Wiederholungen und Batch-Effekte
- Library-Typen und Sequenziertiefe
- Aligner und Pseudo-Aligner
- Reads pro Gen zählen
- Qualitätskontrollen nach dem Mapping
- Normalisierungsverfahren
- DESeq2 und edgeR
- Expressionsergebnisse darstellen
- Gene-Ontology-Anreicherung
- KEGG und Pathway-Analyse
- CAZymes und pilzspezifische Annotationen
- Grundlagen der Massenspektrometrie
- Verarbeitung von Proteomikdaten
- Ungezielte Metabolomik
- Korrelations- und Netzwerkansätze
- Multi-Omics-Faktoranalyse
- Integrierte Ergebnisse deuten
5.3Praktikum im Unternehmen
Dieses Programm umfasst kein Praktikum im Unternehmen. Die Praxis ist über Übungen, Fallstudien und das Abschlussprojekt in jedes Modul eingebaut.
5.4Abschlussprojekt
Eine vollständige Analyse eines öffentlichen RNA-seq-Datensatzes eines Pilzes, ergänzt um eine weitere Omics-Ebene, sofern verfügbar.
Methodik
6.1So wird unterrichtet
- Live-Sitzungen online, meist wöchentlich, mit einer Fachperson aus der Praxis und einer kleinen Gruppe.
- Aufzeichnungen jeder Sitzung, damit du bei Arbeit oder Zeitverschiebung aufholen kannst.
- Übungen und echte Fallstudien in jedem Modul.
- Betreuung: deine Lehrperson beantwortet Fragen und gibt Feedback zu Übungen und Projekt.
6.2Plattform und Ressourcen
Ein virtueller Moodle-Campus mit Aufzeichnungen, Lektüren, Übungen und Foren zu jedem Modul. Du brauchst einen Computer, einen aktuellen Browser und eine stabile Verbindung; Kamera und Mikrofon werden empfohlen.
Technische Voraussetzungen →6.3Geschätzter Wochenaufwand
Etwa 6 Stunden pro Woche über 12 Wochen: eine zweistündige Live-Sitzung an einem Wochentagabend, dazu Selbststudium und Übungen auf dem Campus in deinem Tempo.
Bewertung
7.1Bewertungssystem und Gewichtung
Der Lernfortschritt wird über die Teilnahme an den Live-Sitzungen, Analyseübungen in jedem Modul und ein vom Dozenten begutachtetes Abschlussprojekt bewertet.
7.2Voraussetzungen für den Abschluss
- Alle Module abschliessen, durch Teilnahme an den Live-Sitzungen oder über die Aufzeichnungen.
- Die Modulübungen einreichen.
- Dein Abschlussprojekt von deiner Lehrperson freigeben lassen.
Lehrteam
8.1Akademische Leitung
Die Schule Digitale Mykologie von Fungaris verantwortet Inhalte und Qualität dieses Programms. Die akademische Leitung jeder Durchführung wird im Leitfaden genannt.
8.2Lehrende
Es unterrichten Fachleute, die in diesem Feld arbeiten. Die Lehrperson jeder Durchführung wird vor dem Start bestätigt.
Unsere Lehrenden →Zertifikat
9.1Erworbenes Zertifikat
Kurszertifikat
Nach Abschluss des Kurses und seines Projekts stellt Fungaris ein Kurszertifikat aus. Die Zertifikate von Fungaris sind eigene Zertifikate des Instituts. Ob Arbeitgeber, Schulen oder Behörden sie anerkennen, hängt von der jeweiligen Stelle und den Regeln im jeweiligen Land ab.
9.2Ausstellende Stelle / Anerkennung
Ausgestellt von Fungaris (betrieben von Nexora Generation, S.L.) als digitales Zertifikat. Es ist ein eigenes Zertifikat von Fungaris, kein staatlich anerkannter Hochschulabschluss, und es vergibt keine ECTS-Punkte.
Über unsere Zertifikate →Zulassung und Anmeldung
10.1Zulassungsverfahren (Schritte)
- Sende deine Anfrage über das Formular oder schreib der Zulassung.
- Die Zulassung prüft dein Profil und bestätigt Startdatum, Sitzungszeiten und Gebühr.
- Du sicherst deinen Platz mit vollständiger Zahlung oder einer Reservierung von 40%.
- Vor der ersten Sitzung erhältst du deinen Campus-Zugang und den Willkommensleitfaden.
10.2Erforderliche Unterlagen
- Ein gültiges Ausweisdokument.
- Kontakt- und Rechnungsdaten (privat oder Firma).
10.3Fristen
Die Anmeldung für die Durchführung ab 11. Januar 2027 ist bis 4. Januar 2027 offen oder bis die Gruppe voll ist (höchstens 20 Teilnehmende).
10.4Gebühr und Zahlungsarten
Gebühr: CHF 390
- Vollständige Zahlung vor Beginn: CHF 312 (20% Ermässigung).
- 40% Reservierung (CHF 156) und 3 Monatsraten à CHF 78.
10.5Förderung, Rabatte und Finanzierung
Rabatte: 10% für ehemalige Teilnehmende von Fungaris und 15% für Gruppen ab drei Personen derselben Organisation. Rabatte sind nicht miteinander oder mit der Ermässigung bei Vollzahlung kombinierbar.
Dein Arbeitgeber kann das Programm bezahlen und erhält die Rechnung auf den Firmennamen. Ob ein öffentliches oder betriebliches Weiterbildungsbudget die Gebühr abdeckt, hängt von deinem Land ab; frag dort nach.
10.6Stornierungsbedingungen
Die Bedingungen für Stornierung, Widerruf oder Wechsel in eine spätere Durchführung findest du in unseren Stornierungsbedingungen und in deiner Anmeldebestätigung. Deine Rechte nach dem geltenden Verbraucherrecht bleiben davon unberührt.
Stornierung und Rückerstattung →Weitere Informationen
11.1Häufige Fragen
Brauche ich Vorkenntnisse für „Transkriptomik und Multi-Omics von Pilzen“?
Molekularbiologische Grundkenntnisse und etwas Erfahrung mit R oder der Kommandozeile werden erwartet.
Wie wird „Transkriptomik und Multi-Omics von Pilzen“ unterrichtet?
Live online, in 6 Modulen, mit einer Fachperson aus der Praxis, einer kleinen Gruppe und einem Abschlussprojekt.
Wie werde ich bewertet?
Der Lernfortschritt wird über die Teilnahme an den Live-Sitzungen, Analyseübungen in jedem Modul und ein vom Dozenten begutachtetes Abschlussprojekt bewertet.
Wie sieht das Abschlussprojekt aus?
Eine vollständige Analyse eines öffentlichen RNA-seq-Datensatzes eines Pilzes, ergänzt um eine weitere Omics-Ebene, sofern verfügbar.
Welches Zertifikat erhalte ich?
Nach Abschluss des Kurses und seines Projekts stellt Fungaris ein Kurszertifikat aus. Die Zertifikate von Fungaris sind eigene Zertifikate des Instituts. Ob Arbeitgeber, Schulen oder Behörden sie anerkennen, hängt von der jeweiligen Stelle und den Regeln im jeweiligen Land ab.
Was kann ich nach „Transkriptomik und Multi-Omics von Pilzen“ lernen?
Der naheliegende nächste Schritt ist „Zertifikatslehrgang Pilz-Bioinformatik“.
11.2Stimmen von Absolventen
Wir veröffentlichen nur geprüfte Stimmen echter Teilnehmender. Für dieses Programm gibt es noch keine; sie erscheinen hier, sobald die ersten Durchführungen abgeschlossen sind.
11.3Kontakt zur Zulassung
Schreib an info@fungaris.institute oder nutze das Kontaktformular. Die Zulassung antwortet in deiner Sprache.
Verzweige dich weiter.
Sei beim nächsten Starttermin dabei.
Zahle den Gesamtbetrag mit 20 % Ermässigung oder sichere dir deinen Platz mit 40 % Anzahlung und zahle den Rest in Monatsraten. Alle Preise werden in Schweizer Franken (CHF) angegeben.