Champignons endophytes et marins, sources de nouveaux composés

Ce cours prospectif regarde au-delà des champignons à chapeau, vers l’immense diversité des champignons qui vivent dans les plantes, les sols et les sédiments, ainsi que dans les milieux marins et extrêmes. Vous apprendrez comment on isole les champignons endophytes et marins, pourquoi beaucoup de leurs gènes de biosynthèse restent silencieux en culture standard, comment les approches OSMAC et la co-culture les activent, comment évaluer la nouveauté chimique par la déréplication, et quelles règles juridiques et éthiques encadrent l’accès à ces organismes et leur utilisation.

Les champignons peu étudiés sont une source de plus en plus importante de nouvelles structures chimiques, et la recherche dans ce domaine progresse grâce à de meilleures méthodes d’isolement et d’analyse. Chercheurs, chimistes des produits naturels et étudiants de troisième cycle ont besoin de connaissances pratiques en échantillonnage de terrain, techniques de culture et chimie, ainsi que d’une bonne compréhension des exigences d’accès et de partage des avantages. Le cours aborde la découverte comme un processus de recherche ouvert, sans résultat garanti. Dans votre projet final, vous concevrez une proposition de projet de bioprospection ciblant des champignons endophytes ou marins, avec plan d’échantillonnage, méthodes d’isolement, stratégie de culture, analyse chimique et conformité juridique.