Introduction au diagnostic moléculaire en mycologie médicale
Une introduction à la PCR, au MALDI-TOF, au séquençage et aux tests de biomarqueurs fongiques, avec leurs atouts, leurs limites et leur validation.
Un aperçu de ce que vous allez étudier et réaliser.
Introduction au diagnostic moléculaire en mycologie médicale présente les technologies de laboratoire plus récentes utilisées pour détecter et identifier les champignons. Vous commencerez par les principes de la détection des acides nucléiques, puis vous étudierez les tests PCR pour les champignons pathogènes, la spectrométrie de masse MALDI-TOF pour l'identification rapide, ainsi que le code-barres ADN et le séquençage pour les isolats difficiles. Le cours couvre également les tests antigéniques et de biomarqueurs comme le galactomannane et le bêta-D-glucane, et consacre un module à la validation et aux limites d'interprétation.
Les outils moléculaires et protéomiques transforment la mycologie diagnostique, mais leur intérêt dépend de la compréhension de ce que les résultats peuvent montrer, et de ce qu'ils ne peuvent pas montrer. Ce cours s'adresse aux biologistes et au personnel de laboratoire qui souhaitent travailler avec assurance avec ces méthodes ou les évaluer pour leur service. Les formateurs sont des spécialistes en exercice de diagnostic moléculaire. Pour le projet final, vous préparez l'évaluation critique d'un test moléculaire ou de biomarqueur pour un contexte de laboratoire défini, couvrant son principe, ses données de performance, les besoins de validation, les aspects de coût et les précautions d'interprétation.
6 modules, un savoir qui grandit pas à pas.
Survolez ou touchez un module pour suivre le parcours, de la première séance au projet final. Ouvrez un module pour voir les thèmes abordés.
- Extraction de l'ADN fongique
- Cibles comme l'ITS et l'ADNr
- Maîtrise des contaminations
- PCR panfongique et PCR spécifique
- Formats de PCR en temps réel
- Tests commerciaux et maison
- Principe de l'identification par MALDI-TOF
- Préparation des échantillons fongiques
- Bibliothèques de référence et leurs lacunes
- Séquençage Sanger et codes-barres
- Utiliser les bases de données de référence
- Introduction au séquençage de nouvelle génération
- Galactomannane
- Bêta-D-glucane
- Antigène cryptococcique et autres tests antigéniques
- Sensibilité, spécificité et valeurs prédictives
- Vérification et validation
- Communiquer l'incertitude
Introduction au diagnostic moléculaire en mycologie médicale
À l’issue de la formation, vous saurez :
- Expliquer les principes de l'extraction et de l'amplification des acides nucléiques fongiques.
- Décrire comment le MALDI-TOF identifie les isolats fongiques, et ses limites.
- Utiliser les bases de données de séquences pour appuyer l'identification fongique.
- Interpréter en contexte les résultats des tests antigéniques et de biomarqueurs.
- Évaluer les données de validation et de performance d'un test moléculaire.
La place de cette formation dans l’école.
Où cette formation peut vous mener.
Des métiers et des applications qui s’appuient sur ce que vous apprenez ici. Les débouchés dépendent de votre expérience et du marché local.
- Biologiste en diagnostic moléculaire
- Technicien de laboratoire réalisant des tests PCR
- Spécialiste d'application pour des entreprises de diagnostic
- Poste d'appui au sein d'une équipe de laboratoire de mycologie clinique
- Technicien de recherche en génomique fongique
Prérequis, évaluation et certificat.
Conditions d’admission
Des connaissances de base en microbiologie et une expérience de laboratoire sont recommandées ; des notions de biologie moléculaire sont utiles mais pas obligatoires.
Modalités d’évaluation
La progression est évaluée par la participation aux séances en direct et par des exercices d'interprétation de données dans chaque module. L'évaluation finale est relue par le professeur.
Projet final
L'évaluation critique d'un test moléculaire ou de biomarqueur pour un contexte de laboratoire défini.
Certificat
Certificat de cours
À l’issue de la formation et de son projet, Fungaris délivre un Certificat de cours. La reconnaissance des formations est évaluée en fonction du parcours suivi et de la réglementation locale de chaque pays.
Comment la formation progresse, phase par phase.
- Principes de la détection des acides nucléiques
- Tests PCR pour les champignons pathogènes
- Spectrométrie de masse MALDI-TOF
- Code-barres ADN et séquençage
- Tests antigéniques et biomarqueurs
- Validation et limites d'interprétation
Recherches associées
Questions sur cette formation
Faut-il de l’expérience pour suivre la formation « Introduction au diagnostic moléculaire en mycologie médicale » ?
Des connaissances de base en microbiologie et une expérience de laboratoire sont recommandées ; des notions de biologie moléculaire sont utiles mais pas obligatoires.
Comment se déroule la formation « Introduction au diagnostic moléculaire en mycologie médicale » ?
En direct en ligne, en 6 modules, avec un professionnel en activité, un petit groupe et un projet final.
Comment suis-je évalué ?
La progression est évaluée par la participation aux séances en direct et par des exercices d'interprétation de données dans chaque module. L'évaluation finale est relue par le professeur.
En quoi consiste le projet final ?
L'évaluation critique d'un test moléculaire ou de biomarqueur pour un contexte de laboratoire défini.
Quel certificat vais-je obtenir ?
À l’issue de la formation et de son projet, Fungaris délivre un Certificat de cours. La reconnaissance des formations est évaluée en fonction du parcours suivi et de la réglementation locale de chaque pays.
Que puis-je étudier après la formation « Introduction au diagnostic moléculaire en mycologie médicale » ?
L’étape suivante naturelle est la formation « Certificat en fondamentaux de la mycologie médicale ».
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